Выполняет функции аэропорта федерального значения, обеспечивая экономическую загрузку самолётов II группы, является базовым аэропортом для воздушного сообщения с труднодоступными и отдаленными районами Республики Бурятия.
Обеспечивает прямые ежедневные рейсы в Москву, а также регулярные рейсы в города Восточной Сибири.
Благодаря преимуществам по метеорологическим условиям, аэропорт Улан-Удэ используется в качестве запасного для аэропортов Иркутска и Читы.
29—30 апреля 2008 года прошла третья сессия Народного Хурала Республики Бурятия четвертого созыва, где было принято постановление «О переименовании международного аэропорта Улан-Удэ «Мухино» в международный аэропорт Улан-Удэ «Байкал».